Cette section présente différentes plateformes (bibliothèques numériques, bases de données, archives ouvertes, moteurs de recherche, etc.) utilisées pour le partage des résultats de la recherche.

Moteurs de recherche spécialisés dans les documents en libre accès

• CORE est un moteur de recherche dont le développement est soutenu par le JISC et The Open University (Royaume-Uni). Ce service expérimental d’analyse sémantique permet de chercher des textes par similitudes parmi une base de 10 million d’articles en libre accès.

Les deux moteurs de recherche suivants sont présentés sur le site d'OpenEdition.

• BASE est le moteur de recherche mis au point par l’université de Bielefeld en Allemagne. Il n’indexe que des documents en open access, provenant de milliers de sources ouvertes dans le monde, et couvre tous les champs disciplinaires. Son interface est disponible en français.
• ISIDORE est une plateforme de recherche permettant l'accès à des documents numériques de sciences humaines et sociales (SHS). Ouverte à tous et en particulier aux enseignants, chercheurs, doctorants et étudiants, elle s'appuie sur les principes du web de données et donne accès à des données en accès libre (open access). ISIDORE est une réalisation de la très grande infrastructure de recherche Huma-Num (CCSD-CNRS, Aix-Marseille Université, Campus Condorcet). Un marché de réalisation a été confié à un consortium composé des sociétés Antidot, Sword et Mondéca.

Autres moteurs de recherche

• Google Scholar est un moteur de recherche d'articles scientifiques lancé en 2004 qui inventorie des articles approuvés ou non par des comités de lecture, des thèses, des citations ou encore des livres scientifiques.

Plusieurs moteurs de recherche spécialisés dans les articles scientifiques ont fermé ou ne sont plus mis à jour. C’est le cas de Live Search Academic depuis 2008 et Microsoft Academic Search depuis 2014, tous deux développés par Microsoft ; ainsi que de Scirus depuis 2014, qui était développé par Elsevier.

Moteurs de recommandations de flux d’actualité scientifique

• PubChase est un moteur de recommandation de littérature biomédicale, qui est connecté au logiciel de gestion bibliographique Mendeley. PubChase a recours aux modélisations statistiques et à la fouille de données afin de générer des recommandations personnalisées d’articles en fonction des articles précédemment sélectionné par l’internaute.
• Meta Science (anciennement Sciencescape Inc.) est un site web de gestion de contenu qui recommande des articles scientifiques à l’utilisateur grâce aux algorithmes de Machine Learning. Meta Science est connecté au moteur de recherche de données bibliographiques PubMed dans le secteur de la biologie et de la médecine.
• Sparrho est un moteur de recommandations qui fournit des flux d’actualité scientifique personnalités anglophone grâce à l’utilisation d’algorithmes d’apprentissage automatique (Machine Learning) qui sélectionnent les contenus pertinents. La recherche d’article peut se faire en incluant et/ou excluant des mots-clés, revues, auteurs. La startup, basée au Royaume-Uni, a été créée en juillet 2013. Voir l'article...

Revues spécialisées de scientométrie

• Cybermetrics, International Journal of Scientometrics, Informetrics and Bibliometrics, est publié depuis 1997.

• JASIST, Journal of the Association for Information Science and Technology, est publié depuis 1950.

• Journal of Informetrics est publié par Elsevier depuis 2007.

• Journal of Scientometric Research est publié par Wolters Kluwer Health Medical Research depuis 2012.

• Scientometrics - An International Journal for all Quantitative Aspects of the Science of Science, Communication in Science and Science Policy -, est publié par Springer depuis 1978.

• Les titres spécialisés de IEEE.

Bibliographie
Bibliographie partiellement tirée de Scientometric Portal, site web créé par Hamid R. Jamali (maître de conférence à l’Université Charles Sturt, en Australie).

• Anderes, A. (2009). Measuring Academic Research: How to undertake a bibliometric study. Oxford: Chandos.
• Borgman, C.L. (1990). Scholarly communication and bibliometrics: Sage Publications.
• Borner, K. (2010). Atlas of Science: Visualizing What We Know: MIT Press.
• Braam, R.R. (1991). Mapping of science: foci of intellectual interest in scientific literature: DSWO Press, University of Leiden.
• Braun, T. (2007). The Impact Factor of Scientific and Scholarly Journals: Its Use and Misuse in Research Evaluation: Akadémiai Kiadó.
• Braun, T. (2008). The Hirsch-index for evaluating science and scientists. Its uses and misuses: Akadémiai Kiadó.
• Chiesa, V., & Frattini, F. (2009). Evaluation and performance measurement of research and development: techniques and perspectives for multi-level analysis: Edward Elgar.
• Cronin, B. & Sugimoto, C.R., (Eds.) (2015). Scholarly metrics under the microscope. Medford, NJ: Information Today.
• De Bellis, N. (2009). Bibliometrics and Citation Analysis: From the Science Citation Index to Cybermetrics. Lanham: Scarecrow Press.
• Eom, S. (2009). Author cocitation Analysis: Quantitative Methods for Mapping the Intellectual Structure of an Academic Discipline. Hershey: Information Science Reference.
• Evered, D., & Harnett, S. (1989). The Evaluation of Scientific Research: Wiley.
• Geisler, E. (2000). The metrics of science and technology: Quorum Books.
• Harzing, A.W. (2010). The Publish Or Perish Book: Your Guide to Effective and Responsible Citation Analysis: Tarma Software Research.
• Hasan, N. (2010). Mapping the dynamics of world agricultural research output: A scientometric study LAP LAMBERT Academic Publishing.
• Holden, G., Rosenberg, G., & Barker, K. (2006). Bibliometrics in social work: Haworth Social Work Practice Press. Leydesdorff, L. (2001). The Challenge of Scientometrics: The Development, Measurement, and Self-Organization of Scientific Communications: Universal-Publishers.
• Moed, H.F., Glänzel, W., & Schmoch, U. (2004). Handbook of quantitative science and technology research: the use of publication and patent statistics in studies of S & T systems: Kluwer Academic Publishers.
• Peltier C., « Pascal Pansu, Nicole Dubois, Jean-Léon Beauvois, Dis-moi qui te cite et je saurai ce que tu vaux. Que mesure vraiment la bibliométrie ? Presses universitaires de Grenoble, 2013, 127 pages», Questions de communication 2/2013 (n° 24), p. 287-289. www.cairn.info/revue-questions-de-communication-2013-2-page-287.htm.
• Rao, I.K.R. (2010). Growth of Literature and Measures of Scientific Productivity: Scientometric Models, Ess Ess Publications.
• Roemer, R. C. & Borchardt, R. (2015). Meaningful Metrics: A 21st Century Librarian's Guide to Bibliometrics, Altmetrics, and Research Impact, ACRL.
• Santo, A.E. (1978). A measure of the dimensions of interdisciplinarity of two applied sciences: a scientometric model: University of Wisconsin.
• Sinha, S. C. & Zhiman, A. K. (2001). Citation Analysis of Research Field and Information Technology Development. ESS ESS Publications.
• Surand M.-G., « La scientométrie : une méthode d’évaluation de la recherche ? », Communication et organisation, 10 | 1996, mis en ligne le 26 mars 2012. http://communicationorganisation.revues.org/1881
• Tattersall, A. (editor) (2015). Altmetrics: A practical guide for librarians, researchers and academics, Facet Publishing.
• Vinkler, P. (2010). The Evaluation of Research by Scientometric Indicators. Oxford: Chandos.
• Whitley, R., & Gläser, J. (2007). The changing governance of the sciences: the advent of research evaluation systems: Springer.
• Zhao, D. & Strotmann, A.(2015). Analysis and Visualization of Citation Networks, Morgan & Claypool Publishers. Voir l'article...

Analyse bibliométrique et scientométrique

• Bibexcel est un logiciel gratuit créé par Olle Persson qui permet de convertir des données bibliographiques textuelles en fichiers de données importables sur un logiciel tableur (tel que Excel) afin y être analysées.

• CiteSpace est un logiciel gratuit en Java utile pour visualiser et analyser les formes et tendances de la littérature scientifique. Sa source primaire de données est ISI Web of Science (WoS), mais également PubMed, arXiv, ADS, et NSF Award Abstracts. Il peut être utilisé pour générer des cartes dans Google Earth, basées sur la localisation géographique des auteurs.

• CitNetExplorer est un logiciel gratuit en Java développé par l’Université de Leiden pour visualiser et analyser les réseaux de citations de publications scientifiques. Il permet d’importer directement des réseaux de citations depuis la base de données Web of Science.

• Publish or Perish est un logiciel qui récupère des citations bibliographiques dans Google Scholar puis calcule le nombre de citations par article, par auteur et par année ainsi que l’indice h, l’indice g et d’autres indices bibliométriques.

• SAINT (Science Assessment Integrated Network Toolkit) est un logiciel open source pour l’analyse scientométrique. C’est l’un des rares outils permettant de convertir des données initialement en format ISI (Thompson Scientific/Institute for Scientific Information, utilisé dans Web of Science), en base de données relationnelle (en format dbm, accdb ou sql).

• VOSviewer est un programme de cartographie et d’analyse bibliométrique en Java développé par l’Université de Leiden, qui permet d’analyser et de visualiser des réseaux de publications, suivant des mots-clés, citations, co-auteurs et institutions.

Analyse et visualisation des réseaux

Cytoscape	Gephi
NetDraw	NodeXL

• CFinder est un logiciel gratuit, basé sur la méthode Clique Percolation (CPM), permettant de trouver et de visualiser des groupes de nœuds plus densément connectés les uns aux autres dans un réseau.

• Cytoscape est un logiciel gratuit et open source en Java. Originellement dédié à la recherche en bio-informatique, Cytoscape est désormais une plateforme généraliste pour l’analyse et la visualisation de réseaux complexes, y compris des multigraphes ou les réseaux multiniveaux.

• Gephi est un logiciel gratuit et open source d'analyse et de visualisation de réseaux (réseaux complexes, dynamiques, multiniveaux, etc.), développé en Java et basé sur la plateforme NetBeans. Il a été initialement développé par des étudiants de l'Université de technologie de Compiègne (UTC) en France.

• NetDraw est un logiciel gratuit développé par Steve Borgatti (professeur à l’Université du Kentucky, Etats-Unis) pour visualiser des donnés de réseaux sociaux. Il utilise les formats des logiciels Pajek, UCINET ainsi que son propre format le VNA.

• NodeXL est un progiciel gratuit, open source, permettant de représenter des graphiques et des réseaux à partir de MS Excel. Les réseaux peuvent être importés et exportés en différents formats de données (ex : UCINet, Pajek) et à partir de plateformes comme Twitter, Flickr, YouTube et des boîtes mails.

• Pajek est un logiciel libre, open source, en Python, pour visualiser et analysre de grands réseaux. Il fait partie des logiciels d’analyse de réseaux les plus largement utilisés par les experts en scientométrie.

Text and data mining

• GROBID (GeneRation Of BIbliographic Dataset) est un outil d’apprentissage automatique (Machine Learning, en anglais) qui permet l’extraction, l’analyse et la re-structuration de documents bruts, tels que des PDF, en documents TEI, notamment pour des publications scientifiques. Cet outil, principalement développé par Patrice Lopez (INRIA), est disponible en open source depuis 2011. Une présentation PPT de GROBID faite par Patrice Lopez à la journée data4ist est disponible.

Tanagra

Tanagra est un logiciel gratuit d'exploration de données destiné à l’enseignement et à la recherche. Mis en ligne en 2003, Tanagra est devenu en 2006 un projet éducatif plus large qui s’accompagne maintenant d’une documentation sous forme de cours et de tutoriels accessibles gratuitement.

• Rapid Miner est un logiciel de data mining et text mining, développé par la société du même nom, dont la version de base est disponible gratuitement.

• TEXTrend est une plateforme d’analyse et de visualisation d’informations web en science et économie. Les outils de base de TEXTrend sont disponibles gratuitement. TEXTrend est compatible, entre autres, avec les logiciels Weka (classification), R (analyse statistique), Cytoscape et Cfiner (analyse et visualisation de réseaux).

• Weka est une suite de logiciels libres d’apprentissage automatique, en Java, développé à l’origine par l'université de Waikato en Nouvelle-Zélande. En 2005, Weka a reçu le Data Mining and Knowledge Discovery Service Award décerné par l’association SIGKDD.

Le centre UK NACTeM (National Centre for Text Mining) fournit des liens vers des outils de TDM.

Statistique

• R est un logiciel libre de traitement des données et d'analyse statistiques utilisant le langage de programmation S.

Outils d’analyse de bases de données d’éditeurs

Outils d’analyse des bases de données de moteurs de recherche

• Scholarometer est une extension Firefox, qui utilise Google Scholar pour analyser les publications d’un auteur ou d’un groupe d’auteurs.

• Les citations contenues dans la base de données de Google Scholar peuvent également être importées dans les logiciels BibTeX, Zotero, Endnote, etc.

• CiteseerX est à la fois un moteur de recherche et une librairie numérique dont l’index permet d'ordonner des publications par nombre de citations.

Altmetrics
Les altmetrics (Article Level Metrics) sont un ensemble de méthodes et d'outils complémentaires pour analyser l’impact des travaux de recherche. La production scientifique est analysée à partir de supports variés : traditionnels (articles scientifiques) mais également innovants (vidéos, posts de blogs, bases de données, pages web, logiciels, etc.). Diverses activités numériques sont analysées telles que les partages, recommandations, réutilisations de documents (identifiés par un DOI) et de pages web (identifiées par une URL).

• ImpactStory est un outil open source, gratuit, développé par un organisme sans but lucratif, qui fournit des métriques alternatives (altmetrics) pour aider les chercheurs à mesurer l’impact de leurs travaux. L’identification à ImpactStory se fait via un identifiant Orcid, permettant une analyse des documents avec DOIs.

• PlumX Metrics est un outil (payant) développé depuis 2012 par le groupe EBSCO qui permet de connaître l’utilisation faite en temps réel d’articles de recherche, grâce à des indicateurs (usages, captures, mentions, media sociaux et citations) et différentes sources (dont PLOS, PubMed et YouTube). PlumX est utilisé entre autres par l’Université d’Helsinki.

• Public Library of Science (PLOS) est un éditeur en open access qui fournit depuis 2009 des métriques au niveau des articles, pour tous ses journaux, concernant les téléchargements, citations et partages.

Altmetric.com est une entreprise basée à Londres qui fournit des services payants d'analyse d'activités en ligne liées aux résultats de la recherche. Voir l'article...