Victime dans les années 2000 de l'ouverture à la concurrence du marché de la formation, elle est en proie, dès 2009, à d'importantes difficultés financières obligeant l'Etat à lui accorder, en 2012, un prêt de 200 millions d'euros. En 2015, la loi "Rebsamen" amorce la transformation de l'association en un établissement public à caractère industriel et commercial (Epic), effective en 2017. Outre le changement de statut, l'Epic abouti à la création de 2 filiales commerciales, l'une dédiée aux marchés publics, l'autre aux marchés privés.
Source : http://www.gref-bretagne.com/Actualites/Revue-de-presse/Formation.-L-Afpa-doit-definir-un-nouveau-modele-economique