Créé en 1983, le Fongecif Poitou-Charentes est composé à parité de représentants des organisations syndicales patronales (CGPME, MEDEF et l’UPA) et salariales (CFE-CGC, CFDT, CFTC, CGT et la CGT-FO ).
Le Conseil d’administration définit de façon concertée les orientations de l’organisme, fixe les priorités d’action, se prononce sur les principaux actes de gestion et procédures, vote un budget et en contrôle l’exécution.
Les commissions paritaires répondent aux demandes de financement des différents dispositifs et assurent le bon respect des priorités du Fongecif Poitou-Charentes.
Il nomme un directeur, à qui il délégue sous l'autorité du Président le fonctionnement de l'organisme.